La première église du Saint-Sacrement à Lille est construite à l'initiative et sur les fonds personnels du curé d'une paroisse voisine du quartier de Fives après la Première Guerre mondiale et donnée à l'association diocésaine en 1926. Elle est détruite lors d'un bombardement, en 1944. Le nouvel édifice, élevé par l'architecte Gustave Gruson entre 1950 et 1953, est conçu à partir des données recueillies par le curé de la paroisse Pierre Flipo. Ce dernier, au cours de ses voyages en Suisse et aux Etats-Unis pour collecter des fonds destinés à la reconstruction de l'église en plus des dommages de guerre, a repéré plusieurs éléments de l'église Saint-Antoine de Bâle, de l'église d'Aaran en Suisse (vitraux) ou encore de la gare de Washington (alvéoles avec lumières incandescentes) qu'il souhaite voir utiliser dans son église.