Le presbytère de Flines-lez-Mortagne se situe dans le centre ancien du bourg, à proximité immédiate de l'église Saint-Martin. Le corps de logis est adjoint de deux appentis. Sa façade ordonnancée est à cinq travées, avec la travée centrale marquée d'une niche bordant la toiture, abritant la statue de saint Joseph et l'Enfant. Au rez-de-chaussée, les baies ont des linteaux en plein cintre, tandis qu'à l'étage, ces derniers sont droits. L'ensemble est animé d'un décor de brique : pilastres d'angle, bandeau, corniche et clef en ciment pour les baies. La couverture, en croupe avec coyau en débord de toiture, a été refaite en tuile mécanique.