Le cimetière se situe à son emplacement d'origine, autour de l'église. D'après les documents de la série O des Archives départementales de l'Oise, une circulaire du préfet impose en 1845 à la commune de statuer sur son maintien ou son déplacement. Cette incitation fait suite à l'ordonnance royale de 1843 imposant aux municipalités d'éloigner les cimetières des habitations et d'établir des règlements et tarifications pour les concessions. Le conseil municipal de Bonvillers décide alors de maintenir le cimetière à sa place car il est suffisamment à l'écart des habitations et assez grand pour accueillir de nouvelles tombes.

D'après les documents de l'Association pour la Connaissance et la Conservation des Calvaires et Croix du Beauvaisis, un cimetière militaire a été créé contre la clôture sud en avril 1918 lors de la bataille de Cantigny. À cette occasion, le château de Bonvillers devient une ambulance pour les blessés. En 1920, le cimetière a été démantelé et les 300 corps restitués aux familles.

Les monuments funéraires les plus anciens datent essentiellement du milieu du XIXe siècle et comprennent des croix en fonte et fer forgé, des stèles en calcaire et un alignement de chapelles le long de la clôture sud (voir celle de la famille d'Haudicourt et Cauvel de Beauvillé en ill.). Seuls les deux tombeaux en forme de sarcophage dans la partie nord du cimetière pourraient avoir été réalisés à la limite entre les XVIIIe et XIXe siècles (ill.).